Nem ápol túl jó viszonyt a balliberális váci városvezetés a történelmi egyházakkal. A polgármester a felszínen ugyan udvarias, korábbi megnyilatkozásaiban viszont többször is kritikát fogalmazott meg az egyházakkal szemben. Még újságíróként 2007-ben egyik cikkében például azt állította, hogy az 1920-as, '30-as években a katolicizmus államvallás volt, noha az országot akkor vezető Horthy Miklós református volt. Ráadásul Matkovich Ilona szerint a katolikus egyház a valóságosnál nagyobb erőt, illetve közéleti jelenlétet igyekszik mutatni.
Vác egyik alpolgármestere, Inotay Gergely, aki legutóbb összellenzéki jelöltként kétharmados vereséget szenvedett a parlamenti választáson a Fidesz-KDNP-s Rétvári Bencétől korábban katolikus hitoktató volt, de a váci szivárványkoalícióban több, magát jobboldalinak mondó helyi politikus is ül. Ennek ellenére a városvezetés mereven elzárkózik az oktatási célú egyházi ingatlanok tulajdonjogának visszaadása elől, pedig erre a törvény kötelezi az önkormányzatot.
