Az Emberi Erőforrások Minisztériumának közleménye szerint, az intézet feladata a többi közt a magyarság őstörténetének és a középkornak a kutatása lesz, de foglalkozik majd a magyarság önazonosság tudatával, a nyelvvel és kultúrával is.
Kásler Miklós miniszter korábban azt mondta: az őstörténet kutatásakor a tudományágak képviselői eddig elbeszélnek egymás mellett, az új kutatásokkal pedig véget vethetnénk a régi türk-finnugor eredetvitának. A magyarságkutató főigazgatójának Horváth-Lugossy Gábort nevezte ki a miniszter.
